79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0364 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  100 
 
 
146 aa  300  5.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.68 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  28.93 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  30.33 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  32 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  37.66 
 
 
536 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  27.7 
 
 
223 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  32.22 
 
 
649 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  26.09 
 
 
176 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  29.7 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  28.16 
 
 
623 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.96 
 
 
616 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.96 
 
 
616 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  25.37 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  34.25 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  29.63 
 
 
391 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  28.28 
 
 
569 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.67 
 
 
627 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  26.67 
 
 
627 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.67 
 
 
627 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  26.67 
 
 
627 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.67 
 
 
627 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.67 
 
 
627 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.1 
 
 
624 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  25 
 
 
618 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  30.49 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  26.92 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  34.72 
 
 
658 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  26.67 
 
 
627 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.17 
 
 
789 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  29.36 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  25.58 
 
 
590 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  25.26 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  27.62 
 
 
627 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  31.82 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.08 
 
 
752 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  37.74 
 
 
531 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.82 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  27.27 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0496  hypothetical protein  28.16 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  28.57 
 
 
471 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  28.81 
 
 
224 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  26.13 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  26.73 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.85 
 
 
699 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 
611 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  22.76 
 
 
162 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  27.27 
 
 
614 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1262  Thioredoxin domain  25.81 
 
 
128 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000573175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.93 
 
 
582 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.84 
 
 
666 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  25.4 
 
 
574 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0499  hypothetical protein  25.61 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3323  hypothetical protein  25.61 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  24.51 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1100  hypothetical protein  25.61 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2327  hypothetical protein  25.61 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3279  thioredoxin family protein  25.61 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0785061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3312  thioredoxin family protein  25.61 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2207  hypothetical protein  25.61 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  27.47 
 
 
589 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  29.31 
 
 
650 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.05 
 
 
606 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  30.77 
 
 
643 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  22.02 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  27.17 
 
 
642 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  25.26 
 
 
639 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  26.76 
 
 
632 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  27.27 
 
 
611 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  26.6 
 
 
357 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.09 
 
 
673 aa  40  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.09 
 
 
658 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  25.83 
 
 
270 aa  40  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  27.27 
 
 
615 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  27.27 
 
 
615 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1041  putative thioredoxin protein  23.6 
 
 
141 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  26.37 
 
 
589 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>