More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0294 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0294  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133878  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0262  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 178 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  50 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  51.52 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  50 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 		 176 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  42.37 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  45.76 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 122 aa  103  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0761  ribosomal protein L17  48 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  50.51 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  50.48 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  43.52 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  43.22 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  44.64 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  43.41 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  53.06 
 
 		 197 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  46.85 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  43.22 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  40.68 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 226 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  42.37 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  42.37 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  50 
 
 		 268 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  46.22 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  42.37 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0743  ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>