More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1038 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  100 
 
 		 261 aa  508  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  61.69 
 
 		 261 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  61.69 
 
 		 261 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  61.69 
 
 		 261 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  61.69 
 
 		 261 aa  332  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  61.3 
 
 		 261 aa  331  8e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  61.3 
 
 		 261 aa  331  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  61.3 
 
 		 261 aa  330  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  61.3 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  61.3 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  61.69 
 
 		 261 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  61.69 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  61.3 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  61.3 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  61.3 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  60.15 
 
 		 261 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  62.31 
 
 		 261 aa  323  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  59.07 
 
 		 261 aa  301  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  58.85 
 
 		 261 aa  298  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  59.39 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  59.39 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  59.39 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  59.07 
 
 		 261 aa  294  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  60.38 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  58.92 
 
 		 261 aa  268  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  57.48 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  54.41 
 
 		 261 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  56.17 
 
 		 262 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  55.74 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  50.98 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  52.36 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  54.92 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  52.87 
 
 		 263 aa  235  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  54.7 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  54.27 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  54.22 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  51 
 
 		 273 aa  234  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  47.98 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  45.63 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  45.42 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  53.39 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  52.54 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  53.39 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  47.64 
 
 		 262 aa  214  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  47.58 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  46.25 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  51.45 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  46.18 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  46.88 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  46.59 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  53.39 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  48.06 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  45.49 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  44.59 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  47.01 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  51.52 
 
 		 267 aa  204  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  47.58 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  44.16 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  42.29 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  49.38 
 
 		 266 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  44.2 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  46.43 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  42.56 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  42.56 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.96 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.47 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  34.43 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  34.11 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  35.43 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.61 
 
 		 281 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  32.92 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  35.04 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  35.86 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.38 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  34.02 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.62 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.62 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  31.08 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  32 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  32.07 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.24 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  32.29 
 
 		 289 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.54 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.16 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.16 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  28.17 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.12 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.1 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  31.62 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.43 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.2 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0182  ABC-3 protein  37.04 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0759014  decreased coverage  0.00115812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>