More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4354 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4354  thiolase  100 
 
 		 387 aa  784    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  47.93 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 		 387 aa  356  5e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  47.41 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.94 
 
 		 387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  42.49 
 
 		 392 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  42.49 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  41.22 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  41.48 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.26 
 
 		 388 aa  298  9e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  42.08 
 
 		 388 aa  298  9e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.23 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  41.97 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  42.49 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  40.98 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  41.45 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.16 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  41.84 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  41.33 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.98 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.76 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  43.15 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.76 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  40.57 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  40.66 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  41.03 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  39.8 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  39.12 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  38.23 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  38.46 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.98 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  37.28 
 
 		 389 aa  236  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  40.05 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  36.06 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  38.66 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  37.44 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  37.28 
 
 		 389 aa  229  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  37.63 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  36.02 
 
 		 404 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  36.41 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.34 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  38.93 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.92 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.06 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  36.62 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.72 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.62 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  36.12 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  37.95 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  39.33 
 
 		 460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.23 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  36.25 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  39.34 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.58 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  35.8 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  36.32 
 
 		 413 aa  216  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  38.01 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  35.73 
 
 		 389 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  36.08 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  37.18 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.91 
 
 		 376 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.08 
 
 		 388 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  36.67 
 
 		 389 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 		 388 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  35.34 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  34.59 
 
 		 414 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  35.97 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  34.16 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  34.16 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.39 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  35.48 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  36.32 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  37.18 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  34.69 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  36.15 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  35.32 
 
 		 413 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  33.92 
 
 		 413 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  37.82 
 
 		 388 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  34.29 
 
 		 392 aa  199  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  36.08 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  38.05 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.13 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  38.08 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.99 
 
 		 395 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1143  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.97 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525995  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.38 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  32.09 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>