More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4178 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  983    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  55.56 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  56.79 
 
 		 484 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  56.59 
 
 		 478 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  50.82 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  46.15 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  43.91 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  28.19 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  28.89 
 
 		 510 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  26.5 
 
 		 515 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  25.46 
 
 		 515 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  25.25 
 
 		 515 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  34.62 
 
 		 1305 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  31.69 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  30.92 
 
 		 571 aa  73.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  23 
 
 		 525 aa  73.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 		 634 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  36.43 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  28.82 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  35.66 
 
 		 523 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  35.66 
 
 		 523 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  30.38 
 
 		 631 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  29.8 
 
 		 266 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  50 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  29.66 
 
 		 266 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 		 289 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  31.65 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  44.16 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  30.49 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.35 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.88 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  32.28 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  29.65 
 
 		 1120 aa  60.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  29.65 
 
 		 1120 aa  60.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  41.98 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  31.55 
 
 		 1118 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  32.54 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.29 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  32.12 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  29.26 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  27.33 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  28.34 
 
 		 1148 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  28.04 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  30.28 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  28.04 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  28.04 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  24.59 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.58 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3978  transglutaminase-like  32.41 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.58 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.58 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  32 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  32.12 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  38.96 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  34.62 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  31.08 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  34.55 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 		 290 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  25.53 
 
 		 272 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1100 aa  57  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  28.67 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  27.33 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  29.61 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.99 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  28.76 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  28.86 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 279 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  35.48 
 
 		 276 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  32 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  25.76 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  26.56 
 
 		 391 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  26.56 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  38.89 
 
 		 311 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  28.26 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  28.66 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  31.87 
 
 		 321 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  28 
 
 		 289 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  28.08 
 
 		 1100 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  27.54 
 
 		 272 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  37.33 
 
 		 288 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  31.62 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  28.87 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 269 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0967  transglutaminase-like  33.66 
 
 		 301 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  hitchhiker  0.00428968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.17 
 
 		 316 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  31.86 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  28.26 
 
 		 259 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 		 272 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  28.42 
 
 		 277 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3955  transglutaminase domain protein  29.31 
 
 		 568 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.59806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  28.49 
 
 		 1145 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  28.71 
 
 		 263 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  29.03 
 
 		 1149 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  30.89 
 
 		 268 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  27.4 
 
 		 269 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  29.61 
 
 		 257 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  33.77 
 
 		 1078 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>