More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2079 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  70.92 
 
 		 283 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  69.15 
 
 		 283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  64.54 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  63.21 
 
 		 284 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  63.48 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  60.14 
 
 		 283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  57.8 
 
 		 283 aa  331  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  56.27 
 
 		 281 aa  330  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 		 281 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 		 281 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  53.76 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 		 281 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  299  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  292  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 280 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  53.33 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 278 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 281 aa  281  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  48.93 
 
 		 277 aa  275  8e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  52.28 
 
 		 289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 279 aa  271  9e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 283 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  52.98 
 
 		 289 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  52.98 
 
 		 289 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.97 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 285 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 287 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 288 aa  255  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 282 aa  254  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 282 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 284 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  45.68 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>