More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0507 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 406 aa  835    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  56.65 
 
 		 406 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0548  glycosyl transferase family 9  27.62 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0259889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1745  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 406 aa  136  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1411  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.91 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.49 
 
 		 348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.67 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  28.82 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  24.18 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.85 
 
 		 359 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.66 
 
 		 368 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  28.74 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0465  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.49 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  28.04 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0319  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.44 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  21.95 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  25.71 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1574  glycosyl transferase family 9  25.06 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.42 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25.93 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  27.01 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  27.01 
 
 		 365 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  26.74 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  25.4 
 
 		 371 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.25 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  26.85 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  27.12 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.72 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  26.01 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.35 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  22.99 
 
 		 330 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.55 
 
 		 367 aa  93.2  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.36 
 
 		 360 aa  93.2  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.41 
 
 		 367 aa  93.2  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  27.51 
 
 		 356 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  27.51 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  23.78 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.86 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.17 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 354 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 348 aa  90.1  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  23.68 
 
 		 352 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.35 
 
 		 353 aa  89.7  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  27.33 
 
 		 347 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.12 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.89 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  27.35 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.96 
 
 		 339 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  24.57 
 
 		 352 aa  87  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 323 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.89 
 
 		 458 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  23.76 
 
 		 779 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 354 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 347 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  26.62 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.21 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  25.78 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.86 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.86 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.86 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.86 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.09 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.29 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.22 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.33 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.84 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  25.99 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.27 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.27 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.27 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.71 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.84 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.53 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.59 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>