273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0267 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  100 
 
 
153 aa  317  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  58.22 
 
 
176 aa  189  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  56.85 
 
 
176 aa  189  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  53.33 
 
 
153 aa  167  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  52.67 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  53.47 
 
 
200 aa  159  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  51.03 
 
 
194 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  50.69 
 
 
191 aa  156  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  50.64 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  49.66 
 
 
156 aa  153  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  50.67 
 
 
150 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  48.67 
 
 
193 aa  148  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  50.67 
 
 
150 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  48.05 
 
 
181 aa  147  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  50.67 
 
 
150 aa  147  6e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  46.58 
 
 
206 aa  143  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  46.05 
 
 
157 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  45.75 
 
 
185 aa  142  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  47.97 
 
 
149 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  47.89 
 
 
149 aa  140  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  47.97 
 
 
149 aa  140  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  48.41 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  45.45 
 
 
179 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  45.95 
 
 
155 aa  135  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  49.33 
 
 
184 aa  134  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  46.26 
 
 
175 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  46.26 
 
 
175 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  44.9 
 
 
149 aa  134  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  44.23 
 
 
156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  45.81 
 
 
191 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  45.81 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  48.72 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  43.95 
 
 
157 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  48 
 
 
183 aa  127  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  43.59 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  41.45 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  48.65 
 
 
181 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  48.98 
 
 
149 aa  120  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  46.5 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  46.15 
 
 
159 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  46.15 
 
 
159 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  41.45 
 
 
173 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  42.55 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  46.79 
 
 
159 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  43.24 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  41.06 
 
 
150 aa  111  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  41.67 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  43.62 
 
 
150 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  42.14 
 
 
159 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  41.51 
 
 
159 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  40.54 
 
 
150 aa  103  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  42.28 
 
 
150 aa  103  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  41.26 
 
 
153 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  40 
 
 
201 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  42.14 
 
 
159 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  39.13 
 
 
192 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  38 
 
 
149 aa  101  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  38.06 
 
 
190 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  37.27 
 
 
617 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1514  PEBP family protein  38.41 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0212174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  38.06 
 
 
190 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  38.12 
 
 
207 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  37.65 
 
 
179 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  38.13 
 
 
169 aa  97.1  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  36.77 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  37.09 
 
 
192 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  39.46 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  38.1 
 
 
180 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  37.58 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  34.87 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  38.12 
 
 
181 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  42.31 
 
 
153 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  37.25 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  41.22 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  35.46 
 
 
185 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1322  PEBP family protein  34.97 
 
 
151 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  38.06 
 
 
179 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  33.09 
 
 
188 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  39.61 
 
 
187 aa  88.2  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  36.13 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  38.78 
 
 
204 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0343  PEBP family protein  32.17 
 
 
155 aa  87.4  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  49.46 
 
 
177 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  34.42 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  36.5 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  35.44 
 
 
210 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  36.84 
 
 
194 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  32.48 
 
 
182 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2899  PEBP family protein  31.71 
 
 
218 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.970699  normal  0.309684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  37.25 
 
 
156 aa  84  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  35 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  35.03 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  33.77 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  33.77 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  33.55 
 
 
179 aa  82  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  33.77 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  37.93 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  32.48 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  34.78 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  33.77 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>