More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2815 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2815  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180318  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  57.45 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2108  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.66 
 
 		 243 aa  251  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.32 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1933  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.71 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2766  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  47.6 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2570  response regulator receiver  55.26 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.16396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 225 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.37 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.74 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  41.53 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  43.53 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  44.3 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40.95 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.95 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.1 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  43.42 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  40.87 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.29 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0395  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40.95 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  40.95 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  40.95 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  40.95 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  40.95 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40.95 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  40.95 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00362669  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.7 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.95 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  39.13 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  41.53 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1076  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  36.86 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>