96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0227 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  100 
 
 		 390 aa  748    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  47.48 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  32.43 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  38.96 
 
 		 376 aa  130  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  42.18 
 
 		 1140 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  43.18 
 
 		 1140 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 		 1129 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  40.99 
 
 		 1140 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  34.36 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  37.3 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  30.34 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  35.51 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  35.39 
 
 		 612 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  32.3 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  30.21 
 
 		 332 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  33.61 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  30.17 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  32.81 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  37.74 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  37.74 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  37.74 
 
 		 409 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  40 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  30.96 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  29.59 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  30.12 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  37.26 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  33.62 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  30.8 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  38.21 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  39.2 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  38.21 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  39.2 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  28.62 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  37.26 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  33.74 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  39.34 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  32.86 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  31.8 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  31.8 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  31.8 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  31.8 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  31.8 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  31.74 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  30.08 
 
 		 1152 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  35.41 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  32.7 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  36.1 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  36.1 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  36.1 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  36.1 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  36.1 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  36.1 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  32.23 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  32.23 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  32.23 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  32.23 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  32.23 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  32.23 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  32.23 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  32.14 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  27.23 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  30.61 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  30.61 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  31.07 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  32.67 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  30.3 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  32.04 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  34.21 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  34.21 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  32.67 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  28.64 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  27.71 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  29.96 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  32.81 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  29.35 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  28.91 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  23.83 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  31.98 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 511 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  27.04 
 
 		 1748 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  30.82 
 
 		 1223 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  30.6 
 
 		 2690 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 		 430 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  27.78 
 
 		 543 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 		 912 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2247  glycosy hydrolase family protein  23.44 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  26.01 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  26.87 
 
 		 609 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1959  hypothetical protein  24.81 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.987661  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  31.19 
 
 		 2807 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>