76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1138 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  56.98 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  56.93 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  37.93 
 
 		 349 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  37.93 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  38.33 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  38.51 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  47.97 
 
 		 199 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  38.67 
 
 		 161 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  34.31 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  30.65 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 229 aa  89.7  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  40.13 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  40.13 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  31.88 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0821  hypothetical protein  45.36 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  30.48 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  30.2 
 
 		 589 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  32.87 
 
 		 615 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 592 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  27.42 
 
 		 602 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  26.22 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 		 641 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  38.05 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  31.15 
 
 		 574 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  26.25 
 
 		 605 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 578 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  29.07 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 587 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 602 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  27.23 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 617 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 596 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 581 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  35.29 
 
 		 504 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.67 
 
 		 606 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  29.09 
 
 		 610 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  30.33 
 
 		 602 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  25.61 
 
 		 598 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 		 596 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  24.31 
 
 		 676 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  25.68 
 
 		 611 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  26 
 
 		 594 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  24.5 
 
 		 576 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  26.8 
 
 		 499 aa  48.9  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  25 
 
 		 599 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  24.86 
 
 		 616 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  32.46 
 
 		 599 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  25.95 
 
 		 730 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  25.95 
 
 		 729 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  25.95 
 
 		 729 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  23.96 
 
 		 596 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 618 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  30.6 
 
 		 725 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 589 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  26.19 
 
 		 589 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  25.87 
 
 		 724 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  28.76 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  25.89 
 
 		 794 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  30.19 
 
 		 1981 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  26.85 
 
 		 1095 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 		 576 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  24.45 
 
 		 595 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  25.2 
 
 		 771 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 		 619 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  26.29 
 
 		 613 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  21.59 
 
 		 714 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  25.68 
 
 		 618 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 775 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 775 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 775 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 775 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>