242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2207 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
302 aa  624  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  70.37 
 
 
300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  65.41 
 
 
299 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  66.33 
 
 
297 aa  394  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.65 
 
 
296 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  29.89 
 
 
307 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.54 
 
 
289 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  26.75 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.77 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.12 
 
 
307 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.5 
 
 
314 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.54 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.8 
 
 
304 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.7 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.71 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.62 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  26.87 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.24 
 
 
303 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.35 
 
 
286 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.75 
 
 
290 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.84 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.84 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.84 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.47 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.03 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.61 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  25.76 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  28.43 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.78 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.35 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
552 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.72 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  25.38 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.68 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  29.59 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.83 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.92 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  29.59 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.08 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  28.03 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.93 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.19 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.32 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  26.22 
 
 
307 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  25.75 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.56 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  24.32 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  23.73 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.2 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.46 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
610 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
606 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.48 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
610 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.4 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
567 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.65 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.97 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.28 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
572 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.38 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  26.35 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.72 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.72 
 
 
594 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.39 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.92 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.3 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
606 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  28.15 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.79 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.89 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  27.78 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  27.78 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
567 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.09 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
619 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  24.15 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.16 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.23 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
629 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
585 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.57 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
619 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.69 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.8 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
623 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
572 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
619 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.46 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.27 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.85 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.53 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  26.2 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  24.44 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>