More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1621 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  75.58 
 
 
221 aa  332  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  77.07 
 
 
219 aa  324  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  73.21 
 
 
225 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  69.23 
 
 
225 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  69.52 
 
 
222 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  63.72 
 
 
216 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  64.04 
 
 
214 aa  277  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  68.52 
 
 
226 aa  277  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  56.74 
 
 
221 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  56.16 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  57.77 
 
 
219 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  57.92 
 
 
199 aa  226  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  52.71 
 
 
199 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  52.71 
 
 
198 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  52.71 
 
 
220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  51.49 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  51.14 
 
 
216 aa  184  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  48.68 
 
 
190 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  42.74 
 
 
240 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  39.74 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  40.25 
 
 
255 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  42.03 
 
 
288 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  41.59 
 
 
251 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.62 
 
 
256 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  46.77 
 
 
171 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  45.65 
 
 
173 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  41.09 
 
 
267 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  41.46 
 
 
262 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  40.65 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.06 
 
 
299 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  40.2 
 
 
248 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  40.2 
 
 
248 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  42.05 
 
 
185 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  33.21 
 
 
275 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  36.8 
 
 
268 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  38.63 
 
 
299 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  39.53 
 
 
324 aa  150  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  39.04 
 
 
257 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  41.5 
 
 
266 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  37.66 
 
 
305 aa  148  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  36.28 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  34.4 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  42.39 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  36.52 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  36.52 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  43.62 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  32.61 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  38.28 
 
 
283 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  36.28 
 
 
297 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  37.38 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  41.21 
 
 
284 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.78 
 
 
305 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  33.94 
 
 
268 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  39.25 
 
 
262 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  32.44 
 
 
268 aa  144  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  37.88 
 
 
184 aa  144  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  41.15 
 
 
284 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  41.15 
 
 
284 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  36.1 
 
 
340 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  40.41 
 
 
267 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  37.44 
 
 
269 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  39.66 
 
 
297 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  44.39 
 
 
274 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  39.66 
 
 
297 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  29.71 
 
 
276 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  37.23 
 
 
297 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  39.66 
 
 
297 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  37.23 
 
 
297 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  40.96 
 
 
284 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  39.66 
 
 
297 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  37.93 
 
 
297 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  40.43 
 
 
284 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  41.88 
 
 
284 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  40.33 
 
 
187 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  36 
 
 
324 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  32.37 
 
 
276 aa  141  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  34.63 
 
 
268 aa  141  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  35 
 
 
305 aa  141  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.71 
 
 
305 aa  141  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  40.1 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  30.26 
 
 
289 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  39.9 
 
 
284 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  38.86 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  34.17 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  36.36 
 
 
284 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  35.53 
 
 
322 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  39.7 
 
 
214 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  41.58 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  35.22 
 
 
299 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  36.56 
 
 
322 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  41 
 
 
185 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  35.4 
 
 
321 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  38.6 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  35.84 
 
 
325 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.51 
 
 
299 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  34.07 
 
 
325 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  35.15 
 
 
305 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  38 
 
 
263 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  32.82 
 
 
305 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>