More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0532 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
370 aa  760    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  50.27 
 
 
372 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.94 
 
 
382 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2947  extracellular ligand-binding receptor  39.54 
 
 
367 aa  258  9e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.752891  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  35.66 
 
 
373 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  36.21 
 
 
377 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  34.07 
 
 
413 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0744  Extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 
381 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2831  substrate-binding protein, putative  31.82 
 
 
375 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00332473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 
404 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
404 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.53 
 
 
404 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 
383 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 
376 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
382 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
368 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
372 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
419 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  26.39 
 
 
371 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
384 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
372 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
399 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
400 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 
412 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.89 
 
 
380 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.7 
 
 
388 aa  97.1  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.03 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.07 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 
396 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.53 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.94 
 
 
397 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
377 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 
383 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
390 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.48 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4926  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560657  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 
405 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.01 
 
 
385 aa  89.7  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  26.22 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
396 aa  89.7  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
396 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
381 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 
386 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
373 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 
386 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.32 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3025  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.69 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
397 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
392 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.85 
 
 
383 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 
401 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
386 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 
400 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  24.08 
 
 
393 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.51 
 
 
402 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  25.09 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.32 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.76 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>