More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4078 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4078  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 412 aa  839    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1763  aminotransferase, class I and II  69.65 
 
 		 417 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59119  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.78 
 
 		 463 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 395 aa  245  8e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.85 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 386 aa  239  4e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 		 433 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.15 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  36.27 
 
 		 440 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 409 aa  232  9e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 396 aa  232  9e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.4 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.22 
 
 		 398 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  36.64 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 416 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 440 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 398 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 413 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.84 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  33.25 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.5 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.9 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  33.08 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  35.66 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  37.15 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  37.15 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  37.15 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  37.15 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  37.15 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  37.15 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 414 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  33.25 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  33.6 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 498 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.25 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  35.92 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 		 397 aa  217  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.15 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 393 aa  216  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 611 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  39.23 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  35.44 
 
 		 407 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  34.76 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  33.92 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  32.61 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 393 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 454 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 397 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>