More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3711 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  86.17 
 
 		 188 aa  330  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  81.28 
 
 		 187 aa  317  5e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  87.17 
 
 		 187 aa  312  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  86.1 
 
 		 187 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  86.1 
 
 		 187 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  86.1 
 
 		 187 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  77.3 
 
 		 191 aa  306  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  79.78 
 
 		 192 aa  304  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  79.78 
 
 		 192 aa  303  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  85.03 
 
 		 187 aa  302  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  75.4 
 
 		 187 aa  299  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  84.57 
 
 		 188 aa  298  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  77.09 
 
 		 199 aa  296  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  75.4 
 
 		 198 aa  296  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  74.19 
 
 		 189 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  76.09 
 
 		 193 aa  295  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  81.82 
 
 		 192 aa  293  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  75.54 
 
 		 193 aa  293  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  75.66 
 
 		 190 aa  292  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  71.73 
 
 		 191 aa  290  9e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  73.37 
 
 		 189 aa  289  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  73.12 
 
 		 189 aa  289  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  75.56 
 
 		 191 aa  289  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  78.49 
 
 		 189 aa  289  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  72.04 
 
 		 189 aa  286  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  81.38 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  72.68 
 
 		 194 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  71.12 
 
 		 190 aa  281  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  74.3 
 
 		 196 aa  280  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  76 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  71.04 
 
 		 191 aa  278  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  78.61 
 
 		 189 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 189 aa  275  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 189 aa  275  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  82.12 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  66.84 
 
 		 190 aa  256  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  64.17 
 
 		 190 aa  251  7e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  62.84 
 
 		 186 aa  247  9e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  240  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 183 aa  237  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 180 aa  224  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  58.01 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  57.39 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 180 aa  221  4e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.25 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  58.76 
 
 		 181 aa  221  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 178 aa  221  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 196 aa  220  9e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  58.33 
 
 		 180 aa  220  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  220  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>