More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2609 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 127 aa  246  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  82.68 
 
 		 134 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  82.11 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  75 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  83.49 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  76.86 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  75.68 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  82.91 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  82.91 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  71.31 
 
 		 128 aa  166  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  77.67 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  77.67 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  81.45 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  81.45 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  81.45 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  72.63 
 
 		 127 aa  146  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  72.63 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  67.92 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  65.45 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 		 113 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  59.68 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  68.32 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  65.35 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  67.68 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  67.57 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  56.99 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  59.79 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  58.42 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  40.74 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  58.93 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  58.93 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.37 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  40.4 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  42.86 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  48.65 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  36.71 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  43.42 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  30.59 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  38.81 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  49.28 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>