More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0616 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
327 aa  646    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1254  ABC transporter, permease protein  49.85 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126232 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.53 
 
 
330 aa  291  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.311537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.65 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497916  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
327 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
327 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
327 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
328 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
325 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
325 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
325 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.71 
 
 
344 aa  222  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  38.72 
 
 
325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0817  ABC peptide/nickel transport system permease protein  39.1 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  36.01 
 
 
336 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
325 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000912922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
319 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.5 
 
 
338 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
326 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
327 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
334 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
332 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
321 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
321 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.74 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  30.42 
 
 
318 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.42 
 
 
318 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.42 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.42 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  30.89 
 
 
307 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
307 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
335 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
355 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  30.12 
 
 
318 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
321 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
321 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 
307 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 
321 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
319 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.33 
 
 
318 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
321 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
331 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  29.73 
 
 
321 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
321 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
321 aa  142  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
318 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
321 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  30.63 
 
 
316 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
306 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 
306 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.91 
 
 
333 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
321 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
315 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.01 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.13 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.33 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00108438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.08 
 
 
335 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
317 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  32.62 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
304 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  25.76 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
306 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7517  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  29.04 
 
 
317 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
339 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  27.27 
 
 
321 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.32 
 
 
320 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
321 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
338 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
328 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
334 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.95 
 
 
333 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>