More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2569 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 257 aa  534  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  53.39 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  39.46 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  30.61 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  31.42 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 152 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 241 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  25.21 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  27.56 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.65 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  33.56 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  30.14 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  33.56 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  32.88 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  32.88 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  32.88 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  32.88 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  32.88 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  30.98 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  28.78 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.47 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  30.82 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  30.82 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.5 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  34.78 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  32.37 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  29.5 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  34.51 
 
 		 390 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  26.51 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  26.51 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  26.51 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  28.08 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  30.22 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  27.98 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  27.98 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  30.16 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  24.31 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  25.9 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  34.45 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.65 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  29.93 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  33.93 
 
 		 638 aa  62.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  26.85 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  28.78 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.71 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  37.12 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>