274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2325 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  100 
 
 		 244 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  92.56 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  45.9 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  40.57 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  43.83 
 
 		 243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  41.6 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  41.42 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  38.59 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  42.37 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  42.37 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  40.59 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  40.17 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  40.6 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  38.98 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  38.59 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  39.67 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  39.83 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  35.42 
 
 		 286 aa  164  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  32.78 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  35.93 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  36.82 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  37.97 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  35.64 
 
 		 318 aa  158  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  32.85 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  36.07 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  37.24 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  33.61 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  39.58 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  34.27 
 
 		 308 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  33.9 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  34.44 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  36.73 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  35.98 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  35.14 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  40.17 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  36.1 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  32.17 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  35.56 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  32.3 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  36.97 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  30.88 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  37.44 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  33.45 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  32.17 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  31.96 
 
 		 325 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  35.98 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  32.28 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  31.83 
 
 		 350 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  31.21 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  31.83 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  33.21 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  34.73 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  31.96 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  31.49 
 
 		 312 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  31.96 
 
 		 322 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  35.27 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.66 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  31.37 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  31.8 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  30.93 
 
 		 303 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  30.93 
 
 		 303 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  38.12 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  31.47 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  30.93 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  31.36 
 
 		 289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  32.93 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  29.37 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  33.05 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  32.64 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  28.67 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  34.23 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  31.38 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  31.38 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  31.38 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  32.24 
 
 		 387 aa  122  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  32.77 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  30.6 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  31.92 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  27.97 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  32.5 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  34.92 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  29.92 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  31.48 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  36.97 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  30.48 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  29.55 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  36.46 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  28.97 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  30.58 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  37.58 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  27.97 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  27.48 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  27.04 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  40.27 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  28.12 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  27.76 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>