88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1791 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 504 aa  999    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.25 
 
 		 507 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  22.57 
 
 		 511 aa  96.7  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  21.28 
 
 		 516 aa  94.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 513 aa  93.2  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 498 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  26.06 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  26.06 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  26.06 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  25.35 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  26.32 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  25.51 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 468 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  23.45 
 
 		 522 aa  62  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  21.41 
 
 		 496 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 457 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0117  polysaccharide transport protein, putative  22.53 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000854887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2649  polysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 		 485 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.251579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  22.49 
 
 		 512 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  20.31 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  19.66 
 
 		 591 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  21.24 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 468 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2367  membrane protein for polysaccharide transport  20.86 
 
 		 507 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  22 
 
 		 525 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 517 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 505 aa  50.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2896  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 482 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 448 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 		 497 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 		 471 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 586 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  19.58 
 
 		 484 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  20.11 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  28.09 
 
 		 506 aa  44.3  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 490 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 421 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  20.25 
 
 		 489 aa  43.5  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  20.47 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 507 aa  43.5  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 534 aa  43.5  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>