13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0062 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 510 aa  1031    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  37.08 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1406  polysaccharide biosynthesis protein  33.67 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286894 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1606  putative transmembrane protein  32.81 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.650131 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 522 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 514 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 519 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  20 
 
 		 506 aa  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  19.88 
 
 		 517 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 		 504 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  21.49 
 
 		 522 aa  43.9  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>