More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0916 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0916  cysteine desulfurase  100 
 
 
374 aa  766    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2532  cysteine desulfurase  73.12 
 
 
379 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4564  cysteine desulfurase  59.84 
 
 
380 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4516  cysteine desulfurase  59.3 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4328  cysteine desulfurase  59.3 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4165  cysteine desulfurase  59.03 
 
 
379 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4176  cysteine desulfurase  59.84 
 
 
380 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0211822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0686  cysteine desulfurase  57.95 
 
 
380 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0500544  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4511  cysteine desulfurase  59.3 
 
 
379 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.372925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4549  cysteine desulfurase  58.76 
 
 
380 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4277  cysteine desulfurase  58.49 
 
 
380 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000827813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4663  cysteine desulfurase  58.92 
 
 
377 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3146  cysteine desulfurase  57.14 
 
 
380 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0347283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.81 
 
 
384 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.86 
 
 
384 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.71 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.22 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.4 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.76 
 
 
403 aa  282  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.76 
 
 
392 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  38.3 
 
 
381 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.42 
 
 
399 aa  281  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  38.56 
 
 
381 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  39.73 
 
 
383 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  38.84 
 
 
381 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  38.03 
 
 
381 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  38.03 
 
 
381 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  38.03 
 
 
381 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  38.03 
 
 
381 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.56 
 
 
381 aa  278  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  38.03 
 
 
381 aa  278  9e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  37.77 
 
 
381 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.18 
 
 
398 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  38.3 
 
 
381 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.36 
 
 
383 aa  276  5e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.44 
 
 
382 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  40.43 
 
 
381 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.09 
 
 
383 aa  272  7e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  40.42 
 
 
400 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.68 
 
 
398 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  41.44 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.32 
 
 
400 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.02 
 
 
393 aa  269  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  40.21 
 
 
381 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  38.07 
 
 
394 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  40.05 
 
 
406 aa  266  4e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  40.74 
 
 
417 aa  265  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.19 
 
 
388 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.86 
 
 
388 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  39.73 
 
 
396 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  36.66 
 
 
388 aa  263  3e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.04 
 
 
398 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.38 
 
 
396 aa  262  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.93 
 
 
381 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  40.27 
 
 
388 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  39.25 
 
 
390 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  39.78 
 
 
1143 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.52 
 
 
389 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1929  cysteine desulfurase  43.41 
 
 
386 aa  259  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.95 
 
 
379 aa  259  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.37 
 
 
398 aa  259  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  40 
 
 
1135 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  38.46 
 
 
380 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.4 
 
 
394 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  41.51 
 
 
405 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  40.68 
 
 
393 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.65 
 
 
396 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  38.03 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  40.42 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  39.52 
 
 
383 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  41.14 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  37.53 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  37.9 
 
 
380 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  38.32 
 
 
394 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  38.92 
 
 
394 aa  250  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  36.44 
 
 
398 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  36.44 
 
 
398 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  38.58 
 
 
389 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  39.27 
 
 
398 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  40.12 
 
 
395 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  40.98 
 
 
388 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  40 
 
 
394 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  37.96 
 
 
409 aa  249  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  36.66 
 
 
404 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1191  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.77 
 
 
384 aa  248  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  38.36 
 
 
383 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  39.56 
 
 
407 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  39.56 
 
 
421 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  37.77 
 
 
380 aa  247  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  39.9 
 
 
399 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  39.51 
 
 
403 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  40.55 
 
 
379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  40.44 
 
 
388 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  37.57 
 
 
410 aa  244  9.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  38.8 
 
 
404 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  38.8 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  36.34 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  39.2 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  38.08 
 
 
380 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>