More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0672 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  100 
 
 
436 aa  889    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  80.76 
 
 
427 aa  707    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  72.41 
 
 
426 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  71.36 
 
 
423 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  71.12 
 
 
423 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  71.12 
 
 
423 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  71.36 
 
 
423 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  71.36 
 
 
423 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  70.41 
 
 
423 aa  597  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  70.88 
 
 
423 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  70.88 
 
 
423 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  70.41 
 
 
423 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  70.88 
 
 
423 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  57.79 
 
 
422 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  57.79 
 
 
422 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  55.58 
 
 
420 aa  475  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  54.65 
 
 
426 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  49.4 
 
 
424 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 
409 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  43.75 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  46 
 
 
390 aa  331  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  41.61 
 
 
408 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  44.71 
 
 
393 aa  317  4e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  42.05 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  42.05 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  41.56 
 
 
415 aa  302  7.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  40.78 
 
 
406 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  40.91 
 
 
419 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  39.57 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.01 
 
 
403 aa  279  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.76 
 
 
403 aa  279  9e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  36.69 
 
 
412 aa  272  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  37.65 
 
 
435 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  37.41 
 
 
435 aa  259  8e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  37.41 
 
 
435 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  38.85 
 
 
412 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  38.92 
 
 
433 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  35.1 
 
 
446 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  37.16 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  37.05 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  37.65 
 
 
413 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  35.11 
 
 
414 aa  229  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  33.82 
 
 
412 aa  229  9e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  35.59 
 
 
415 aa  227  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  35.75 
 
 
414 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  35.14 
 
 
410 aa  217  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  34.35 
 
 
408 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  32.52 
 
 
403 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  31.36 
 
 
455 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  32 
 
 
408 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  33.25 
 
 
415 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  33.51 
 
 
413 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  32.82 
 
 
409 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  33.07 
 
 
409 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  31.54 
 
 
403 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  33.17 
 
 
414 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  32.37 
 
 
407 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  32.7 
 
 
414 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  35.07 
 
 
398 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  33.98 
 
 
396 aa  202  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  35.32 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  34.06 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  35.32 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  33.17 
 
 
428 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  35.07 
 
 
398 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  35.07 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  34.22 
 
 
394 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  33.58 
 
 
394 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  33.98 
 
 
394 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  33.58 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  30.57 
 
 
415 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  32.99 
 
 
410 aa  197  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  35.24 
 
 
398 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  35.24 
 
 
460 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  34.99 
 
 
394 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
401 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  34.79 
 
 
394 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  34 
 
 
399 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  29.74 
 
 
404 aa  195  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  33.73 
 
 
411 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  32.2 
 
 
394 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  33.98 
 
 
398 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  32.85 
 
 
393 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  34.99 
 
 
460 aa  193  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  33.41 
 
 
443 aa  193  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  34.32 
 
 
413 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  35.02 
 
 
402 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  33.09 
 
 
394 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  33.09 
 
 
394 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  34.74 
 
 
413 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  33.75 
 
 
397 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  33.09 
 
 
394 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  33.66 
 
 
399 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  33.09 
 
 
394 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  28.95 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  31.45 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  33.16 
 
 
415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  31.89 
 
 
409 aa  190  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>