More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1501 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 303 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  65.37 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 287 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  58.6 
 
 		 287 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  56.44 
 
 		 304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  53.15 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  55.92 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  43 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  51.85 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  43.97 
 
 		 326 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  53.27 
 
 		 247 aa  228  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  51.39 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  49.28 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  40.42 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 367 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  42.25 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  40.28 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  40.28 
 
 		 326 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  39.1 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  41.26 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  40.56 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  37.06 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 241 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  45.69 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 244 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 241 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  44.19 
 
 		 241 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 241 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 241 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 241 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 241 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  37.89 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  41.53 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  42.33 
 
 		 241 aa  185  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  39.91 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  46.95 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  43.5 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  42.13 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  36.54 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  47.12 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  46.33 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  33.44 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  43.05 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  36.32 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  36.97 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  41.43 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.34 
 
 		 301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  35.97 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  34.01 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  36.84 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.5 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  35.33 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40.67 
 
 		 259 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  39.58 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  42.65 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  43.4 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  37.28 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  42.52 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  44.13 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  33.66 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  32.15 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40.19 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 242 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  39.17 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.96 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40.98 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  40.98 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  39.66 
 
 		 246 aa  169  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 297 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  39.46 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  36.1 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0074  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  33.99 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>