64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0185 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  803    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  81.77 
 
 		 402 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  81.73 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  64.69 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  54.57 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  53.98 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0188  hypothetical protein  82.43 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  24.29 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  23.03 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  23.03 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  23.03 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  35.56 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  29.25 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  20.22 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 396 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  20.75 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  26.49 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  28.74 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  20.22 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  23.42 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  19.57 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  19.95 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  33.81 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>