More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3282 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  63.23 
 
 		 606 aa  810    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  61.2 
 
 		 622 aa  803    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  64.79 
 
 		 602 aa  849    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  52 
 
 		 608 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 650 aa  1326    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  92.15 
 
 		 647 aa  1198    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  48.69 
 
 		 589 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  45.58 
 
 		 628 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  40.55 
 
 		 605 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  40.37 
 
 		 607 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  39.02 
 
 		 608 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  39.26 
 
 		 601 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.6 
 
 		 632 aa  435  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  37.76 
 
 		 623 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  38.3 
 
 		 633 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  38.3 
 
 		 632 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  38.22 
 
 		 632 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  38.69 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  38.16 
 
 		 655 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  37.88 
 
 		 633 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  37.84 
 
 		 633 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  37.52 
 
 		 641 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  35.41 
 
 		 647 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.43 
 
 		 645 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 635 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  37.73 
 
 		 625 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  36.76 
 
 		 629 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.99 
 
 		 648 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  37.2 
 
 		 630 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38.3 
 
 		 644 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  36.74 
 
 		 615 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.61 
 
 		 631 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  37.96 
 
 		 670 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.99 
 
 		 602 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  36.36 
 
 		 613 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  37.37 
 
 		 636 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  35.51 
 
 		 652 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 632 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  36 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  36.18 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  36.46 
 
 		 705 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  36.93 
 
 		 611 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  36.41 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  37.52 
 
 		 639 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37 
 
 		 611 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 		 640 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  37.56 
 
 		 606 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  36.25 
 
 		 647 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 611 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  35.88 
 
 		 661 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  37.16 
 
 		 604 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  36.56 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  36.95 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  37.39 
 
 		 644 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  35.51 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  37.98 
 
 		 643 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  35.64 
 
 		 598 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  38.14 
 
 		 648 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  35.73 
 
 		 617 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  36.43 
 
 		 687 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 645 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  36.76 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  36.24 
 
 		 657 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  35.93 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  36.54 
 
 		 657 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.03 
 
 		 612 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  38.19 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  36.72 
 
 		 671 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  36.83 
 
 		 661 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 		 659 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  36.36 
 
 		 628 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  35.89 
 
 		 644 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  36.1 
 
 		 605 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  36.32 
 
 		 681 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  36.2 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  33.82 
 
 		 692 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  35.49 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  34.74 
 
 		 656 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.42 
 
 		 647 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  34.1 
 
 		 619 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  34.24 
 
 		 668 aa  364  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  32.27 
 
 		 647 aa  362  9e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 		 647 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  36.31 
 
 		 660 aa  362  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  35.69 
 
 		 643 aa  362  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  32.67 
 
 		 695 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 		 623 aa  360  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  36.19 
 
 		 687 aa  360  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 626 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 		 623 aa  360  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  31.67 
 
 		 647 aa  360  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 		 647 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 		 644 aa  360  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  31.85 
 
 		 669 aa  359  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>