73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2420 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
115 aa  236  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  94.44 
 
 
116 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  49.51 
 
 
106 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  54 
 
 
113 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  52.43 
 
 
107 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  52.43 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  51.85 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  52.43 
 
 
108 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  52.43 
 
 
108 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  49.51 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  49.06 
 
 
110 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  50.5 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  46.36 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  47.17 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  51.52 
 
 
190 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  41.51 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  52.86 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  42 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  36.54 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  37.72 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  43.62 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  57.14 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  40.66 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  40.66 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  38.95 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  39.81 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  39.81 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  39.78 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  39.78 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  38.83 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  38.83 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  42.86 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  39.05 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  51.85 
 
 
56 aa  60.5  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  55.1 
 
 
56 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  42.67 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  40.48 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  40.91 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  40.54 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  39.19 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  31.78 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  31.78 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  44.29 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  38.89 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  37.84 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  38.89 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  37.66 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  30.84 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  38.89 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  38.89 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  38.89 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  38.89 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  38.6 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  41.89 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  35.14 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  29.81 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  38.67 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  40 
 
 
118 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  32.98 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  38.1 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  39.68 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  29.67 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  27.78 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  37.31 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  28.16 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  33.82 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  28.42 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  28.42 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>