More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6493 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6493  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  253  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0923194  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1747  response regulator receiver protein  47.57 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159822  normal  0.0299244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 220 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 224 aa  80.5  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.27 
 
 		 218 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  36.49 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5807  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.981797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.6 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  39.81 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 391 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 209 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 217 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  39.81 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  39.81 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  39.81 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  32.28 
 
 		 214 aa  72  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.9 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 489 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  35.64 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  39.81 
 
 		 218 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3507  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 219 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.19 
 
 		 199 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.41 
 
 		 254 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 212 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 217 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  32.08 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1500  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  35.92 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.38 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3719  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.092296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  34.21 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  38.83 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  38.26 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 412 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 		 217 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 		 199 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 217 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  36.89 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 243 aa  67  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 224 aa  67  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  37.25 
 
 		 245 aa  67  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0178  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 		 218 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>