More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4877 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  100 
 
 		 327 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  53.05 
 
 		 464 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  43.95 
 
 		 249 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  51.01 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  44.94 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  34.43 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  43.62 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  34.29 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  38.37 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  35.32 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 390 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 253 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  35.1 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  35.12 
 
 		 253 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  27.69 
 
 		 250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  36.51 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.6 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  37.19 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  38.43 
 
 		 241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.48 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.11 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.85 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.85 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  25.61 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  25.61 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.97 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.15 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.03 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 226 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  34.29 
 
 		 559 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.81 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2169  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.75 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  35.12 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.75 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  28 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  29.13 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.37 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 		 268 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  37.07 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  35.11 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  30.63 
 
 		 249 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 232 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 242 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 242 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 209 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  30 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  29.13 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  27 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.32 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 248 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  31 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  28.57 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 250 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  37.84 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>