115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3639 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  339  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  65.22 
 
 
280 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  66.46 
 
 
288 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  59.63 
 
 
215 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  59.63 
 
 
279 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  55.69 
 
 
214 aa  185  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  56.44 
 
 
290 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  51.85 
 
 
279 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  53.85 
 
 
173 aa  167  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  52.44 
 
 
306 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  51.23 
 
 
302 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  47.53 
 
 
279 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  46.91 
 
 
277 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  58.59 
 
 
252 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1745  hypothetical protein  48.26 
 
 
218 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0889269  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  45.51 
 
 
288 aa  137  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  43.83 
 
 
268 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  46.71 
 
 
268 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3109  hypothetical protein  58.04 
 
 
171 aa  134  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0403  hypothetical protein  48.92 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  43.48 
 
 
272 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  47.53 
 
 
273 aa  131  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1516  hypothetical protein  50.34 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  49.66 
 
 
268 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  65.59 
 
 
182 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  46.81 
 
 
264 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  42.86 
 
 
267 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  44.44 
 
 
275 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  47.89 
 
 
266 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  42.94 
 
 
293 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  40.74 
 
 
262 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  41.1 
 
 
279 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  39.51 
 
 
277 aa  117  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  46.48 
 
 
268 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  45.58 
 
 
270 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  42.86 
 
 
268 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  46.81 
 
 
266 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  36.31 
 
 
266 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  45.4 
 
 
263 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  42.86 
 
 
267 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  39.49 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  40.12 
 
 
268 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  43.64 
 
 
270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  43.83 
 
 
271 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  40.71 
 
 
333 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  38.75 
 
 
267 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  39.24 
 
 
280 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  43.11 
 
 
271 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  35.8 
 
 
271 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  40.97 
 
 
283 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  41.55 
 
 
272 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  38.75 
 
 
272 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  37.89 
 
 
281 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  41.42 
 
 
267 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  41.22 
 
 
269 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  41.3 
 
 
284 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  37.04 
 
 
262 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  41.84 
 
 
268 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  37.65 
 
 
277 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  39.64 
 
 
274 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  38.6 
 
 
278 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  38.19 
 
 
274 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  42.77 
 
 
271 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  39.31 
 
 
265 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  38.18 
 
 
275 aa  97.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  39.44 
 
 
283 aa  97.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  37.27 
 
 
263 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  36.2 
 
 
265 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  94.4  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3527  hypothetical protein  62.16 
 
 
81 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672122  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  40.82 
 
 
267 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  40.85 
 
 
266 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  38.1 
 
 
266 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  34.27 
 
 
270 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  34.81 
 
 
253 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  37.69 
 
 
278 aa  91.3  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  31.33 
 
 
277 aa  90.9  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  40.56 
 
 
266 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  38.41 
 
 
328 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  37.59 
 
 
269 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  35.62 
 
 
272 aa  88.6  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  37.5 
 
 
276 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  35.62 
 
 
323 aa  87.4  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  34.38 
 
 
272 aa  87.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  34.36 
 
 
269 aa  87.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  40.99 
 
 
298 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  33.54 
 
 
283 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  35.37 
 
 
274 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  36.73 
 
 
285 aa  84.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  38.26 
 
 
271 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3081  hypothetical protein  54.17 
 
 
72 aa  84  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  34.91 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  38.89 
 
 
271 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  33.56 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  38.13 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  37.59 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  36.3 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  32.35 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  35 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  31.65 
 
 
280 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>