51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2317 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  44.75 
 
 		 358 aa  184  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  55.03 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  59.7 
 
 		 540 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  43.01 
 
 		 1901 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  45.57 
 
 		 705 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  43.39 
 
 		 235 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  51.75 
 
 		 161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  49.68 
 
 		 934 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  41.62 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  44.91 
 
 		 715 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  43.45 
 
 		 911 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 850 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  42.07 
 
 		 785 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  46.58 
 
 		 405 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  40.83 
 
 		 564 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  42.19 
 
 		 388 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  44.12 
 
 		 1355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  39.58 
 
 		 157 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  41.67 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  39.88 
 
 		 238 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  33.18 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  40.16 
 
 		 963 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  40 
 
 		 859 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  39.73 
 
 		 1056 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  40.87 
 
 		 992 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  40.26 
 
 		 829 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  40.87 
 
 		 900 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  37.33 
 
 		 464 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  35.1 
 
 		 1068 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  36.52 
 
 		 899 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  33.15 
 
 		 793 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  36.08 
 
 		 897 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  34.08 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  35.65 
 
 		 1309 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  37.5 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  49.33 
 
 		 373 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.33 
 
 		 880 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.33 
 
 		 880 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1807 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1526 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  32.61 
 
 		 947 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  26 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3638  hypothetical protein  64.52 
 
 		 47 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  24.46 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  34.78 
 
 		 552 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  28.87 
 
 		 485 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  26.97 
 
 		 1048 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  34.67 
 
 		 513 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  25.15 
 
 		 398 aa  42  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>