More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1931 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
268 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  79.7 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.26 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.58 
 
 
272 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.58 
 
 
272 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.58 
 
 
272 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.79 
 
 
274 aa  344  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.2 
 
 
272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.45 
 
 
269 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.04 
 
 
274 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.81 
 
 
269 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.67 
 
 
269 aa  335  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  66.54 
 
 
270 aa  334  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.92 
 
 
270 aa  332  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.77 
 
 
271 aa  330  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.68 
 
 
272 aa  329  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.56 
 
 
269 aa  328  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.67 
 
 
282 aa  327  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.29 
 
 
271 aa  324  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.67 
 
 
267 aa  323  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.67 
 
 
275 aa  322  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.52 
 
 
272 aa  321  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.05 
 
 
270 aa  318  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.21 
 
 
274 aa  318  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.78 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.26 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.55 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.42 
 
 
268 aa  299  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.42 
 
 
268 aa  299  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  64.91 
 
 
287 aa  295  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  62.5 
 
 
260 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.43 
 
 
268 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.59 
 
 
273 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.63 
 
 
273 aa  258  9e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.85 
 
 
272 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.72 
 
 
270 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.68 
 
 
277 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.05 
 
 
271 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.35 
 
 
263 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.64 
 
 
259 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.76 
 
 
258 aa  191  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.22 
 
 
269 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 
265 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
295 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
262 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.66 
 
 
257 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.47 
 
 
263 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.66 
 
 
271 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.72 
 
 
273 aa  185  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
275 aa  182  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.58 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.62 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.14 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.82 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
259 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  42.74 
 
 
259 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.28 
 
 
295 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.25 
 
 
285 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
296 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.78 
 
 
297 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
267 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.54 
 
 
293 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.85 
 
 
269 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.48 
 
 
267 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.94 
 
 
260 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.05 
 
 
285 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.05 
 
 
288 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.16 
 
 
293 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.21 
 
 
257 aa  175  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
268 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.94 
 
 
260 aa  174  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.58 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.75 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.3 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.02 
 
 
278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.3 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.48 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.33 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.05 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.08 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.41 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4370  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
270 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.71 
 
 
258 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
272 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.04 
 
 
271 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 
264 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44 
 
 
270 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.39 
 
 
267 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.94 
 
 
263 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.06 
 
 
258 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.54 
 
 
259 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.65 
 
 
276 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
266 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.47 
 
 
295 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.93 
 
 
294 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.65 
 
 
266 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>