More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1912 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  100 
 
 
304 aa  610  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  50.21 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  38.68 
 
 
249 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  28.98 
 
 
247 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  33.07 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 
250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  34.01 
 
 
251 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 
675 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  29.48 
 
 
637 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
246 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
246 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.29 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 
271 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  29.67 
 
 
253 aa  92.4  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  28.81 
 
 
663 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  37.97 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  38.17 
 
 
245 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  20.72 
 
 
250 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  23.35 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  27.17 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  36 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  27.53 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
255 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.87 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
259 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  31.82 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  30.31 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  25.4 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
244 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  33.54 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  28.95 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  32.22 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  36.09 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 
190 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  22.54 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.71 
 
 
190 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  24.75 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  36.89 
 
 
638 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  24.58 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.64 
 
 
541 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  23.65 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  23.65 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  36.84 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
249 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  28.37 
 
 
249 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  32.43 
 
 
207 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  35.09 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  27.66 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.53 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  23.39 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  27.66 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  27.66 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  27.66 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.66 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  27.66 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  26.8 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  27.66 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.58 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.96 
 
 
189 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.23 
 
 
423 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
244 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  25.88 
 
 
541 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  31.46 
 
 
208 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
226 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  26.95 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  36.7 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  31.13 
 
 
541 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  31.13 
 
 
541 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  40 
 
 
243 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.1 
 
 
239 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  31.1 
 
 
394 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>