112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2035 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 352 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.17 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.59 
 
 		 335 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.74 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.29 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  42.86 
 
 		 331 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  43.99 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.52 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.94 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.36 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  42.27 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  33.9 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  33.9 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  33.15 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  33.15 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  33.62 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  33.05 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  34.46 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  34.27 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  34.76 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.32 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  33.88 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 311 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  24.15 
 
 		 306 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.08 
 
 		 313 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.38 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  23.77 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  23.77 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  30.04 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  31.9 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  28.41 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  25.98 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  28.46 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  29.44 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  23.87 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  24.76 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 876 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  29.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  26.91 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.18 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  29.12 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  25.75 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  29.67 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  28.42 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.1 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  28.96 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  27.87 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  31.4 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.21 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.37 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  27.53 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.68 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  28.8 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 694 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.73 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  24.66 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  22.61 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  26.63 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  26.63 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>