235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1153 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  100 
 
 		 171 aa  342  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  93.64 
 
 		 173 aa  325  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  66.67 
 
 		 180 aa  229  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  63.25 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  62.65 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  63.12 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  69.38 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  57.23 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  53.94 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  53.94 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  53.42 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  52.73 
 
 		 169 aa  184  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  55.21 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  52.76 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  53.37 
 
 		 220 aa  177  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 221 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  56.69 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  52.5 
 
 		 220 aa  174  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  51.55 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  51.55 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  52.53 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  52.5 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  47.24 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  47.13 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  45.86 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  44.79 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  51.55 
 
 		 200 aa  137  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  44.58 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  44.58 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  44.9 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  44.65 
 
 		 189 aa  130  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  38.32 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  44.58 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  45.07 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  45.58 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44.37 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  45.77 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  45.03 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.54 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  40.72 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  41.72 
 
 		 177 aa  121  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40.72 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  45.45 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  45.21 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  46.85 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  40.72 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  40.12 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  42.07 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  46.21 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  40.62 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  36.81 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  37.58 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  47.59 
 
 		 148 aa  114  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  40.24 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  43.66 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  43.17 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36.2 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35.58 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  39.26 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  38.93 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.46 
 
 		 177 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  38.1 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  37.79 
 
 		 194 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  37.43 
 
 		 194 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  37.43 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  38.12 
 
 		 198 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  36.31 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  39.72 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  36.25 
 
 		 198 aa  97.4  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  39.31 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 169 aa  94.4  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  43.06 
 
 		 196 aa  94  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 152 aa  94  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  35.67 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  35.67 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  39.86 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  35.09 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  39.86 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  40.46 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  35.09 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  35.09 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  39.85 
 
 		 198 aa  89  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  35.8 
 
 		 187 aa  87.8  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  34.86 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  38.51 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>