More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0625 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 423 aa  824    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  67.5 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  45.97 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  45.43 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  69.06 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  43.34 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  43.46 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  38.62 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  40.7 
 
 		 366 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 		 362 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.15 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 		 344 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  41.34 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 		 304 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 		 336 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.48 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 		 349 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 306 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 306 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.37 
 
 		 296 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  37.84 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  34.03 
 
 		 352 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  28.35 
 
 		 299 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  33.45 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 276 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 266 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.18 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.05 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 267 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  29.07 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  29.82 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.48 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  28.67 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 340 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 267 aa  67  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 275 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.01 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.39 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.61 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  27.3 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.04 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  31.48 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>