More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4126 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
352 aa  728    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  66.19 
 
 
359 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  47.09 
 
 
353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  44.83 
 
 
358 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  44.81 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.62 
 
 
359 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  41.42 
 
 
360 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  39.17 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 
360 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  30.03 
 
 
376 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 
376 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  31.65 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 
363 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
362 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  24.46 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  20.98 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.82 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 
355 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  23.15 
 
 
442 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  22.96 
 
 
734 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  26.43 
 
 
374 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 
353 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
345 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
680 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  21.93 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  22.01 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  21.56 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.13 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  22.94 
 
 
373 aa  56.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.41 
 
 
339 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  26.09 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  25.5 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3442  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  21.12 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.38 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 
311 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  23.04 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  31.37 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  22.61 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  27.34 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  26.18 
 
 
345 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  22.02 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
381 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  24.12 
 
 
346 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  20.28 
 
 
332 aa  53.1  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
350 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 
387 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  23.57 
 
 
386 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0838  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
367 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.17 
 
 
343 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  23.78 
 
 
353 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.17 
 
 
343 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  23 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  28.91 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  27.34 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>