More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1599 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1599  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2533  LysR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2950  LysR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 336 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.29372  normal  0.491589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4364  LysR family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 352 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4752  transcriptional regulator, LysR family  55.89 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5468  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0722609  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5393  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147064  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3318  LysR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4801  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 		 311 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5351  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4810  LysR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0186  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.142233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1579  transcriptional regulator, LysR family  49.67 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2087  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0306399  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0065  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.75 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 555 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3839  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3510  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0521  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0522  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.17 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2138  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 303 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0149  LyrR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3066  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 299 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1399  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 296 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3267  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1591  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4422  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>