More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1134 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
274 aa  551  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  56.31 
 
 
278 aa  261  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  48.88 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  42.37 
 
 
259 aa  208  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  41.98 
 
 
259 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  42.37 
 
 
259 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  43.5 
 
 
266 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  42.42 
 
 
277 aa  189  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  36.32 
 
 
281 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  36.32 
 
 
286 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 
275 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.14 
 
 
276 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  35.14 
 
 
276 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.14 
 
 
276 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.14 
 
 
276 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.14 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  35.14 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.68 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.68 
 
 
276 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.14 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.79 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.2 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.06 
 
 
273 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 
279 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
277 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
318 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  34.25 
 
 
266 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  33.86 
 
 
266 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  33.86 
 
 
285 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  33.86 
 
 
285 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 
281 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  34.59 
 
 
266 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  35.02 
 
 
266 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  34.9 
 
 
266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  34.9 
 
 
266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  34.9 
 
 
266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 
305 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  34.22 
 
 
266 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
295 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
285 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 
266 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  32.74 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  30.18 
 
 
319 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
276 aa  99  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  30.26 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
341 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 
332 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  31.53 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.67 
 
 
272 aa  95.9  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.94 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.94 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.94 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  29.2 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
294 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0438  antigenic protein  31.28 
 
 
266 aa  94  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30.24 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  32.16 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.93 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
331 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
331 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  28.2 
 
 
323 aa  92.4  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
279 aa  92  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  31.58 
 
 
265 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.08 
 
 
324 aa  92  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
279 aa  92  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
271 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  32.22 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.71 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  29.03 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.45 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.53 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 
355 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  26.87 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  29.95 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  32.38 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  29.82 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  33.82 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  28.44 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  28.82 
 
 
265 aa  89  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 
268 aa  89  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  32.24 
 
 
275 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
250 aa  89  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>