82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3424 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3424  periplasmic copper-binding protein  100 
 
 		 117 aa  238  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0260  periplasmic copper-binding protein  97.44 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4298  periplasmic copper-binding protein  96.58 
 
 		 117 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143185  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  46.61 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  46.61 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  45.76 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  46.61 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  45.76 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  46.61 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  46.61 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  46.61 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2891  hypothetical protein  36.89 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1168  hypothetical protein  36.73 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1262  hypothetical protein  35.45 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3365  hypothetical protein  37.25 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000106692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3072  hypothetical protein  33.05 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 538 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 513 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.1 
 
 		 537 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.42 
 
 		 497 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  31.17 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.16 
 
 		 507 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1154  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  33.63 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1391  putative cation efflux system transmembrane protein  32 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0160925  normal  0.327473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  37.1 
 
 		 537 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  31.11 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  33.8 
 
 		 504 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  31.48 
 
 		 490 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  40.85 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  26.09 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  36.62 
 
 		 546 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  33.96 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  34.33 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  38.33 
 
 		 537 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  30.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  39.66 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  35.16 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  34.29 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  34.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  30.09 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  28.89 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  28 
 
 		 542 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  34.72 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 		 506 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  30.49 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  25.93 
 
 		 577 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  30.49 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 		 523 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  26.17 
 
 		 540 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 		 523 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  30.49 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  30.48 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  31.34 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 		 521 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 		 497 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 		 521 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 		 521 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 		 523 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  40.32 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 		 521 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 502 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  40.98 
 
 		 507 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  34.25 
 
 		 505 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  40.32 
 
 		 509 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  31.34 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  31.34 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  29.17 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.19 
 
 		 497 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.25 
 
 		 517 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  40.98 
 
 		 507 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  42.59 
 
 		 234 aa  40.8  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  40.98 
 
 		 507 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  40 
 
 		 236 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  36.54 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5181  RND family efflux transporter MFP subunit  40.35 
 
 		 505 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  30.09 
 
 		 490 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  30.99 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>