73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1319 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  77.09 
 
 		 179 aa  286  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  77.65 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  57.4 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  58.33 
 
 		 183 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  58.33 
 
 		 183 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  60.65 
 
 		 174 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2713  fimbrial protein  95.29 
 
 		 89 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  46.67 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  39.89 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  40.45 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  39.89 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  38.29 
 
 		 178 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  37.71 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  37.14 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  37.14 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  38.22 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  32.79 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  34.69 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  31.18 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  30.61 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  30.86 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  30.86 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  30.86 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  30.38 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  30.38 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  28.48 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  33 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  28.57 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  30.08 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  30.08 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  30.08 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  30.08 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  28.57 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  33 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  30.08 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  29.75 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  27.67 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  27.67 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  27.67 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  27.92 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  27.56 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  29.46 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.5 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.5 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.5 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.5 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.5 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26.67 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  30.32 
 
 		 171 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  31.03 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  31.03 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  28.68 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  31.03 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  27.41 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.56 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.4 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.56 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.68 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  29.68 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  29.89 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  29.68 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  29.89 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  29.68 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25.5 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  26.39 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  26.39 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  26.39 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.39 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  25.6 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  25.6 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  25.6 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>