More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3055 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02750  methylmalonyl-CoA decarboxylase, biotin-independent  100 
 
 
261 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
261 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02713  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0791  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 
261 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3077  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 
261 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3055  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 
261 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3341  methylmalonyl-CoA decarboxylase  99.62 
 
 
261 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4215  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 
261 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3246  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 
261 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  51.41 
 
 
259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49.4 
 
 
259 aa  278  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  47.45 
 
 
259 aa  268  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49.2 
 
 
260 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49 
 
 
271 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2461  methylmalonyl-CoA decarboxylase  48.19 
 
 
259 aa  254  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000140768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0459  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.4 
 
 
269 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0938  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.4 
 
 
269 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4040  methylmalonyl-CoA decarboxylase  37.4 
 
 
269 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.642217  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0900  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38 
 
 
269 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2996  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.96 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
263 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.7 
 
 
260 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
258 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
261 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
266 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
273 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
258 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
258 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
260 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
258 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
260 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
258 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
259 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.21 
 
 
260 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
262 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  122  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
260 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
260 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
257 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.85 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.58 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.75 
 
 
651 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
267 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.85 
 
 
659 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
256 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.13 
 
 
262 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.7 
 
 
275 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.21 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
260 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
257 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.48 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.48 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  33.33 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
259 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  31.46 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.41 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.54 
 
 
661 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 
259 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 
261 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 
258 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>