More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1466 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  99.53 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  99.53 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  99.53 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  99.53 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  99.53 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  99.53 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  99.53 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  99.07 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  88.37 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  88.37 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  88.37 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  88.37 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  88.37 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  66.67 
 
 		 210 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  65.73 
 
 		 210 aa  274  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  67.65 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  67.65 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  58.74 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000509  nitrate/nitrite response regulator protein  55.98 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  57.35 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05381  transcriptional dual regulator NarL  56.37 
 
 		 204 aa  215  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.46 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  50.49 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  53.69 
 
 		 203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  51.46 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  51.46 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  51.71 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  51.71 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  47.49 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  45.97 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  45.93 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  43.98 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  47.85 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  44.39 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 214 aa  160  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  46.12 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2568  transcriptional regulator NarL  46.6 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2262  transcriptional regulator NarL  46.6 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0331529  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1373  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.276843  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1556  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1898  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.335981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1904  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1962  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  45.37 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.16 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01199  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarX (or NarQ)  44.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2425  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00984481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1330  transcriptional regulator NarL  44.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.724195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1371  transcriptional regulator NarL  44.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.213666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1704  transcriptional regulator NarL  44.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1919  transcriptional regulator NarL  44.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.11445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01209  hypothetical protein  44.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2402  transcriptional regulator NarL  44.39 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1388  transcriptional regulator NarL  44.39 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  37.5 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  44.88 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.44 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  41.83 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2318  transcriptional regulator NarL  43.93 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>