More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000509 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000509  nitrate/nitrite response regulator protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05381  transcriptional dual regulator NarL  94.12 
 
 		 204 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  73.66 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  66.34 
 
 		 203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  58.79 
 
 		 209 aa  244  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  58.79 
 
 		 209 aa  244  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  58.79 
 
 		 209 aa  244  9e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 210 aa  242  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  56.46 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  56.46 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  56.46 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  56.46 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  56.46 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  56.46 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  56.46 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  56.46 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  57.14 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  57.14 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  57.14 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  57.14 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  57.14 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.98 
 
 		 215 aa  237  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  55.88 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  53.4 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  53.4 
 
 		 210 aa  214  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  50.25 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 209 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  52.22 
 
 		 209 aa  201  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  53.73 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  50 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  49.51 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  47.57 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  46.15 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  45.93 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  43.5 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  44.71 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  43.48 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  39.32 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  46.57 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.2 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 303 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1388  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  43.41 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01199  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarX (or NarQ)  44.98 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2425  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00984481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01209  hypothetical protein  44.98 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1330  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.724195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1704  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1371  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.213666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2402  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1919  transcriptional regulator NarL  44.98 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.11445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  147  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  40.09 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  38.39 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  38.39 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  38.39 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  42.93 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  38.39 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  38.39 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  38.39 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  38.39 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  38.39 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1373  transcriptional regulator NarL  44.5 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.276843  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1904  transcriptional regulator NarL  44.5 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1556  transcriptional regulator NarL  44.5 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1898  transcriptional regulator NarL  44.5 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.335981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1962  transcriptional regulator NarL  44.5 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  37.74 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  41.95 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2568  transcriptional regulator NarL  45.41 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2262  transcriptional regulator NarL  45.41 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.33 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>