31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2708 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  92.61 
 
 		 379 aa  713    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  775    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  94.72 
 
 		 379 aa  731    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  26.04 
 
 		 583 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  33 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  26.49 
 
 		 776 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  30.43 
 
 		 565 aa  79.3  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  26.36 
 
 		 788 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  26.36 
 
 		 788 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  26.36 
 
 		 788 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  28.42 
 
 		 603 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  26.97 
 
 		 581 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  29.38 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  27.75 
 
 		 568 aa  66.6  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  26.74 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  23.51 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  24.36 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  28.07 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  25.79 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  29.89 
 
 		 755 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  29.89 
 
 		 755 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  29.89 
 
 		 731 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  25.79 
 
 		 765 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  23.31 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  30 
 
 		 755 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  23.18 
 
 		 615 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  25.51 
 
 		 443 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  24.48 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  22.64 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  23.93 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  26.22 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>