More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2223 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  100 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2782  ABC transporter related  61.97 
 
 		 284 aa  210  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0232  ATPase  54.88 
 
 		 226 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  51.49 
 
 		 337 aa  177  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 247 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1776  ABC transporter related  47.83 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.680063  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  45.87 
 
 		 334 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  48.83 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  42.86 
 
 		 337 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  40.28 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  36.65 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0927  ABC-type transport system, ATPase component  39.91 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  41.43 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0204  protein YabJ  40.48 
 
 		 317 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  38.89 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  34.88 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  44.29 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  40.83 
 
 		 256 aa  131  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  41.43 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1709  tungsten ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.15 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  38.97 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 363 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 357 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  40.58 
 
 		 364 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  38.03 
 
 		 206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1523  tungsten ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.65 
 
 		 331 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  41.45 
 
 		 328 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  34.26 
 
 		 357 aa  128  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 		 360 aa  128  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  38.57 
 
 		 360 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.61 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  35.07 
 
 		 366 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.79 
 
 		 373 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  42.86 
 
 		 356 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 354 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 		 360 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  37.85 
 
 		 357 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  41.2 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 		 357 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 343 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.26 
 
 		 336 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  39.91 
 
 		 343 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  38.32 
 
 		 360 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.32 
 
 		 381 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  38.79 
 
 		 362 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  36.28 
 
 		 353 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 354 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  38.5 
 
 		 352 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.74 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  39.72 
 
 		 359 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 355 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4598  ABC transporter related  41.62 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  38.94 
 
 		 371 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1890  tungsten ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.17 
 
 		 331 aa  121  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.38 
 
 		 370 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  37.74 
 
 		 355 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.79 
 
 		 365 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.81 
 
 		 366 aa  121  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  33.8 
 
 		 367 aa  121  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3754  hypothetical protein  41.71 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 		 365 aa  121  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.09 
 
 		 369 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.91 
 
 		 351 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 		 370 aa  121  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0669112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 		 378 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  37.67 
 
 		 346 aa  121  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.32 
 
 		 362 aa  121  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0872  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.25 
 
 		 385 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 374 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 374 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  40.28 
 
 		 345 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  38.78 
 
 		 365 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  39.42 
 
 		 378 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.79 
 
 		 372 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  36.62 
 
 		 382 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  39.52 
 
 		 334 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  40.19 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 375 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  33.49 
 
 		 350 aa  119  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  39.15 
 
 		 349 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.29 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  36.62 
 
 		 382 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.9 
 
 		 343 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>