More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0848 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0848  glucose inhibited division protein  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1812  glucose inhibited division protein  65.84 
 
 
218 aa  264  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2293  methyltransferase GidB  54.63 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0745  glucose inhibited division protein  53.81 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1605  glucose inhibited division protein  47.4 
 
 
214 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1318  methyltransferase GidB  43.6 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0582047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  32.88 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  35.33 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  32.31 
 
 
207 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  32.18 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  36.14 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  33.16 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  31.96 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  31.16 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  34.16 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  34.73 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2597  methyltransferase GidB  35.71 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.059803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  30.35 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.35 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  30.35 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.35 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  34.67 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.35 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  27.75 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.22 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  30.35 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  30.35 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  34 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  34.88 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  34.16 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  35.16 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  31.77 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  34.88 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  34.16 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  31.67 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  28.29 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  34.38 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  31.72 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  30.11 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  31.75 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  30.19 
 
 
222 aa  72  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.07 
 
 
214 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  28.86 
 
 
213 aa  72  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  29.11 
 
 
201 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 
228 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 
228 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  31.54 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  33.08 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  28.65 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  34.53 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  32.94 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  29.17 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  31.65 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  30.19 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  27.32 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  33.58 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.69 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  29.33 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  33.15 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  32.64 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  29.95 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  30.57 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  35 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  32.61 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.01 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0404  methyltransferase GidB  34.1 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  29.59 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  32.48 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  34.64 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  29.3 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  33.81 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  31.72 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  31.74 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  28 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  35.2 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  29.63 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  30.94 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  27.59 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  32.91 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  31.34 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  30.57 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  31.48 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  26.67 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  28.89 
 
 
219 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  28.12 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>