More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2597 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2597  methyltransferase GidB  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.059803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  42.57 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  41.58 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  43.1 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  41.11 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  41.11 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  41.11 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  41.11 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  41.11 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  41.11 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  41.11 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  41.11 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  42.93 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  42.62 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  39.89 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  41.21 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  38.46 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  41.11 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0002  glucose-inhibited division protein B  45.83 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  40.33 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  43.26 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  43.26 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  37.93 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  43.26 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  37.31 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  39.36 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  37.13 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  36.55 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  39.78 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  38.64 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  39.13 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  36.68 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  35.68 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  37.17 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  35.15 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  37.17 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  38.55 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  38.33 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  35.79 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  40.54 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  37.17 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  36.65 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  38.74 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  39.15 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  36.5 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  35.79 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  37.75 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  39.68 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  39.78 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  40.29 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  40.29 
 
 		 226 aa  124  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  36.5 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 234 aa  124  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  35 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  38.22 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  39.78 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  38.17 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  38.12 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  38.3 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  37.98 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  38.95 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  41.48 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  37.31 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  37.31 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  38.89 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  35.81 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.35 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.16 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  32.09 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.52 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1057  16S rRNA methyltransferase GidB  34.13 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.904694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  35.21 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  43.14 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  36.68 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  42.34 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  42.34 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  35.68 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  38.12 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1321  16S rRNA methyltransferase GidB  32.93 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  39.88 
 
 		 246 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  37.75 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>