49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0901 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  30.14 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  27.27 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  27.03 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  26.79 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  27.41 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  28.71 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  27.84 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  27.32 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  25.48 
 
 
273 aa  81.6  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  27.96 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  26.8 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  28.07 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  26.77 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  27.27 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  24.54 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  24.19 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  26.57 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  25.93 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  26.09 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  23.15 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  28.84 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  25.25 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  23.92 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  27.62 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  26.24 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  26.04 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  25.13 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  30.21 
 
 
310 aa  64.7  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  25.35 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  23.12 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  24.88 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  20.21 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  22.86 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  25.24 
 
 
413 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  22.87 
 
 
237 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  22.86 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  21.9 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  22.97 
 
 
229 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  19.72 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  21.9 
 
 
473 aa  48.9  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  28.24 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  32.67 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  26.05 
 
 
277 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  25.63 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  28.57 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  24.06 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  23.32 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>